Il existe trois méthodes de programmation des machines-outils CNC : la programmation manuelle, la programmation automatique et le centre d'usinage CFAO.
Programmation à la main
L'analyse manuelle des dessins de pièces, le traitement des processus, le calcul numérique, l'écriture de la liste des programmes, la saisie et l'inspection des programmes sont effectués manuellement. Il convient à l'usinage ponctuel ou aux pièces aux géométries moins complexes, mais il prend beaucoup de temps et est sujet aux erreurs lors de la compilation de pièces complexes.
Programmation automatique
Le processus consistant à utiliser un ordinateur ou une machine de programmation pour terminer la préparation des programmes de pièces est très pratique pour les pièces complexes.
CAO/FAO
Les logiciels de CAO/FAO sont utilisés pour réaliser la programmation automatique des modèles et des images. Le logiciel le plus courant est Master CAM, qui peut réaliser la programmation du fraisage 2, 3, 4 et 5, du tournage, de l'électroérosion à fil. Bien que ce type de logiciel n'ait qu'une seule fonction, il est facile à apprendre et peu coûteux.